Der Bahnhof Miyako, welcher von der JR East bewirtschaftet wird und sich auf der Yamada Linie befindet, ist 102,1 Kilometer vom Ausgangspunkt der Linie am Bahnhof Morioka entfernt. Zudem ist er auch eine Endstation der Kita-Rias-Linie der Sanriku-Bahn.

Die Miyako Station hat eine Seitenplattform sowie eine Inselplattform, die jeweils mit dem Bahnhofsgebäude durch eine Fußgängerbrücke verbunden sind. Der Bahnhof hat ein Midori -no-Madoguchi Ticketbüro. Die Seitenplattform wird von der Sanriku-Bahn für nur eine Zugsfahrt pro Tag genutzt. Die Inselplattform hingegen wird sowohl von der Yamada-Linie als auch von der Sanriku-Bahn genutzt.