Die Burg Kumamoto befindet sich mitten in der Stadt Kumamoto. Sie zählt nebst der Burg von Matsumoto und Himeji zu den drei bedeutensten Burgen Japans. Die Burg von Kumamoto wurde zu Beginn der Edo-Zeit unter Katō Kiyomasa von 1601 bis 1607 errichtet. Der Beiname Ginkgo-Burg, geht auf eine Legende zurück, wonach Katō Kiyomasa beim Bau der Burg eigenhändig einen Ginkgobaum gepflanzt haben soll. Obwohl der grosse Ginkgobaum während der Satsuma-Rebellion stark unter Verbrennungen gelitten hatte, trägt er heute wieder Früchte und ist über 400 Jahre alt.

Das Erdbeben am 14. April 2016, mit vielen starken Nachbeben zerstörte mehrere Teile der Burg Kumamoto.