Der Bahnhof Atami ist Haltestelle des Tokaido-Shinkansen und Anschlussstelle der Ito-Linie. Dabei handelt es sich um die einzige Bahnverbindung in den Süden der Izu-Halbinsel. Zudem ist dieser Bahnhof auf der Tokaido-Hauptlinie ein wichtiger Eisenbahnknotenpunkt. Er wird gemeinsam von der JR Higashi-Nihon (JR East) und der JR Tokai (JR Central) betrieben.