Der Yahiko jinja ist ein japanischer Shinto-Schrein in Yahiko. Er befindet sich ungefähr eine Stunde Zugfahrt von der Sanjo Station entfernt und liegt am östlichen Fuss des Yahiko Berges, welcher sich im Sado-Yahiko Quasi-Nationalparks befindet. Der Yahiko Schrein geht bis ins 8. Jahrhundert zurück.

In diesem Schrein wird der Gott Ameno-Kaguyama-no-Mikoto verehrt. Dieser soll angeblich den Menschen gelernt haben, wie Salz aus Meerwasser gewonnen werden kann.

Yahiko war und ist einer der wichtigsten Shinto-Schreine (Ichinomiya) der ehemaligen Echigo Provinz. 1912 wurde der Schrein durch einen Brand, welcher im damaligen Dorf wütete vollständig zerstört. Er wurde jedoch fünf Jahre später wieder aufgebaut.